Корнеллский инструмент AIMe с помощью ИИ предсказывает масс-спектры 100 млн малых молекул
Исследователи Института Бойса Томпсона и Корнелла создали AIMe — нейросимволический ИИ, который строит карту масс-спектров более 100 млн известных малых органических молекул; работа пока опубликована как препринт.
Учёные Института Бойса Томпсона (BTI) и Корнеллского университета создали AIMe (AI Molecule Explorer) — инструмент, который с помощью нейросимволического ИИ предсказывает, упорядочивает и ищет масс-спектры для всего каталога известных малых органических молекул — более 100 млн соединений.
В чём проблема
Масс-спектрометрия в метаболомике даёт огромное число сигналов, которые не удаётся сопоставить ни с одной известной молекулой: эталонные спектры есть лишь для малой доли веществ. AIMe генерирует предсказанные спектры, чтобы неизвестные пики можно было сравнить с огромной картой химического пространства.
Первые результаты
- На более чем 7 млн спектральных кластеров публичной базы GNPS AIMe дал предварительные аннотации примерно для 2,69 млн — против около 416 тыс. в более ранней работе при том же пороге сходства, то есть более чем в шесть раз больше.
- Проект возглавляют Фрэнк Шрёдер (BTI/химфак Корнелла) и Карла Гомес (Институт ИИ для науки Корнелла).
Оговорки
Исследование опубликовано как препринт на bioRxiv и ещё не прошло рецензирование. Аннотации — предварительные прогнозы, требующие экспериментальной проверки. AIMe доступен на сайте Корнелла; исходный код обещают открыть после публикации.