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康奈尔AIMe借助AI预测1亿种小分子的质谱
博伊斯·汤普森研究所与康奈尔大学的研究人员开发出神经符号AI工具AIMe,可为逾1亿种已知小分子有机物绘制质谱图谱;该研究目前仍为预印本。
博伊斯·汤普森研究所(BTI)与康奈尔大学的科学家开发了AIMe(AI分子探索器),利用神经符号人工智能,为全部已知小分子有机物——逾1亿种化合物——预测、整理和检索质谱。
要解决的问题
代谢组学中的质谱实验会产生大量无法与任何已知分子对应的信号,因为只有一小部分化学物质拥有参考质谱。AIMe生成预测质谱,使这些未知峰可以与庞大的可检索化学空间图谱进行比对。
初步结果
- 在公共数据库GNPS的700多万个质谱簇上,AIMe给出了约269万个推定注释;而此前一项研究在相同相似度阈值下仅注释约41.6万个,提高了六倍以上。
- 项目由弗兰克·施罗德(BTI/康奈尔化学系)与卡拉·戈麦斯(康奈尔科学AI研究所)领导。
局限
该研究以bioRxiv预印本形式发布,尚未完成同行评审。注释属于推定预测,仍需实验验证。AIMe可通过康奈尔网站使用,源代码将在论文正式发表后公开。