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长读长DNA测序发现常规检测遗漏的癌症驱动因素,并追溯一名儿童肿瘤与基因治疗的关联
密歇根大学研究人员在《Cancer Discovery》报告,纳米孔长读长测序解释了46例原因不明肿瘤中的32例;另在《新英格兰医学杂志》报告,一名3岁男孩接受基因治疗后,病毒载体片段插入GLI1基因,并出现脊柱旁小肿瘤。
密歇根大学医学中心(Michigan Medicine)的研究人员于2026年10月16日介绍了两项研究,展示纳米孔长读长测序能够发现常规短读长测序遗漏的信息。短读长方法每次读取几百个碱基,长读长方法一次可读取数千至数万个碱基,从而显示突变的排列方式。
研究一:隐藏的癌症驱动因素(《Cancer Discovery》)
- 在768名前列腺癌、乳腺癌或卵巢癌患者中,团队发现46例具有基因组不稳定迹象、常规测序无法解释的肿瘤。长读长测序解释了其中32例,发现了抑癌基因中隐藏的变异或化学修饰。
- 在对3688名患者的4496份肿瘤样本进行的更大范围筛查中,研究人员在部分病例中用长读长测序分析NOTCH1、PDGFRB、KIT和PIK3CA等基因的突变排列——这可能与耐药有关。
- 一名有强烈乳腺癌和卵巢癌家族史、但商业基因检测结果为阴性的女性,经血液长读长测序发现BRCA2基因存在致病性插入。
研究二:基因治疗后出现的肿瘤(《新英格兰医学杂志》)
- 一名患有克拉伯病(一种罕见遗传性神经疾病)的3岁男孩在临床试验中于干细胞移植后接受了递送正常GALC基因的AAV基因治疗。
- 26个月后,常规影像检查发现其脊柱旁有一个小肿瘤。测序显示,修饰后的AAV片段插入了GLI1基因,使这一可促进肿瘤生长的基因活性异常升高。
- 报告发布时,患儿无肿瘤相关症状或神经功能缺陷,正接受影像随访。
局限性
- 《新英格兰医学杂志》论文为单一病例报告,只能说明此类事件可能发生,无法说明发生频率。资深作者**阿鲁尔·钦奈扬(Arul Chinnaiyan)**强调基因治疗”前景广阔”,并呼吁对患者进行长期随访。
- 《Cancer Discovery》结果来自单一中心的测序项目和经筛选的病例,尚未证明该检测能改善患者结局或在常规诊疗中具有成本效益。
- 本文依据大学新闻稿和论文标题撰写,未审阅论文全文。
有关基因检测或基因治疗的问题,请咨询医生或遗传咨询师。